要把这个问题说清楚，得从两个角度来分析：睡眠和时间点；
1，睡眠
现代脑科学研究认为，睡眠就是大脑皮层处于抑制状态；睡不着失眠则是神经衰弱的表现；人在睡熟的状态下脑电波呈现δ（德尔塔）波，当意识清醒，身体还在放松状态时则呈现α（阿尔法）波；当睡意朦胧，半明半白状态时呈现θ（西塔）波，彻底清醒，思维紧张状态则是β（贝塔）波。
中医对睡眠的解释是阴阳交接、阳入于阴；失眠就是阳不入阴；很多情况可以造成阳不入阴：心肾不交，血不归肝、*不守舍、热扰心神，胃不和心不宁，等等；对应于脏腑关系则可能是心阴虚、心血虚、肾阴虚、胃热、胃气嘈杂、肝血虚、肝阴虚、胆热等等；中医认为大脑的兴奋与抑制跟五脏六腑的气机变化息息相关。
原因不一样，失眠的症状也会表现不一样的；有前半夜难入睡的、有后半夜易醒睡不着的、有怎么也睡不着的、也有睡了跟没睡着一样的，梦多；好的睡眠一觉到天明，远离颠倒梦想；半夜突然醒了，但还能睡着，非不算失眠，但也存在一定的问题，这叫“夜惊”。
2，时间点
为什么总是表现在半夜易醒；这就是一个时间点的问题；学中医的都知道时间（时辰）跟气血运行的关系；半夜大概是子时（夜半11点--凌晨1点），头天的后半夜与第二天的凌晨转换的交接点，半阴半阳，阳气开始出于阴，如果受扰动，受阻滞都可能出现突然惊醒；具体可能是思维紧张导致气行不顺，也有可能本身肝气滞，胆热或胆气浊，疏泄不利，还有可能经常的习惯养成的生物钟就是这个点上，得结合实际情况具体分析才能确定，但是要调整的话也是从肝胆疏泄的角度下手。
中医里面不仅有十二时辰制，子丑寅卯辰巳午未，这在西周时就已使用。中医里面还有一些与时间有关的概念：夜半、鸡鸣、平旦、日出、食时、隅中、日中、日昳、晡时、日入、*昏、人定；这在汉代就形成了名称概念。我们所说的夜半，就是子时。所以，要把中医理解透，古古今今都要懂一点，看医案，做临床，最好自己再自我修持一下，估计入门就容易多了，有限的条件下仅靠自己摸索确实不容易。